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网站二级域名的查询方法主要有以下几种：
使用子域名挖掘工具，如Maltego CE、wydomain、subDomainsBrute、dnsmaper、Layer子域名挖掘器等1。
在搜索引擎（如谷歌）中输入“site:主域名”的形式进行查询1。
利用第三方网站查询，例如站长之家的子域名查询工具1。
使用WHOIS查询工具，这是一种专门用于查询域名相关信息的工具，可以查询到二级域名的注册信息，如注册人、注册日期、过期日期、联系方式等12。
使用DNS查询工具进行查询，这种工具可以查询到二级域名的DNS记录等信息1。
关于二级域名的定义，它是指在国际顶级域名或国家顶级域名之下的域名。在国际顶级域名下，二级域名一般是指域名注册人选择使用的网上名称，如“yahoo.com”。上网的商业组织通常使用自己的商标、商号或其他商业标志作为自己的网上名称，如“microsoft.com”3。而在国家顶级域名下，二级域名一般是指类似于国际顶级域名的表示注册人类别和功能的标志。例如，在“.com.cn”域名结构中，“.com”此时是置于国家顶级域名“.cn”下的二级域名，表示商业性组织3。
